研究人員辛苦的把實驗做完，產出很多數據，接下來就是研究寫作、提交手稿。在寫作過程中，很多研究人員滿懷著期待與熱忱要發表高見，但卻經常搞不清楚｢討論｣和｢結論｣有什麼不一樣，這可能會讓該作品抓不住重點，效果大打折扣。
研究寫作中的｢討論｣，其目的是在闡述這篇論文的結果，說明結論中所富含的意義。
首先，討論應該直接回到前面所提出的問題，將結果跟問題連結起來，並將在文獻回顧中所涵蓋的範圍，作成討論的引言。而哪些內容是討論中所必須去著墨的呢？應該要把該研究的主要發現都拿來討論，深入探討這些研究發現的內涵。也把這些發現跟其他文獻的結果作比較，從它們之間相關性加以探討，從已知的論述中可以得到新的發現。對於任何令人意外的、料想不到的、不確定的結果，也要在討論中作出解釋。另外這些研究和發現有沒有什麼限制呢？最後要對未來的進一步研究，提出看法和建議。另外有一些內容不應該在討論中寫出來的，包括：本篇論文的前文中所未提出的數據或未被推導出的結果、未經證實的揣測、與討論不相關的問題、數據所無法證明的結論。
掌握了討論的要點之後，要如何才能寫出好的討論呢？
首先要把所有要列出研究結果作排序，由最重要的結果優先列起，讓讀者易於抓住重點。如果無法決定哪些結果是最重要的，那就回歸本篇論文最初的問題，從這裡出發，看看哪些是最能解決問題的結果，這便是重要的結果。作者的敘事能力是很重要的，要會說故事善加引導讀者，然後將研究發現告訴讀者，不要讓讀者一直花時間翻閱前文找資料，要讓讀者一次看懂。對於研究發現所採用解釋的方法，可以考慮幾種不同的方式、層面、角度、比喻，以強化論述。
「討論」往往是論文中最能夠發揮、暢所欲言的地方；那麽「結論」則是這篇論文的收斂，其結尾必須能總結這些結果，去蕪存菁，讓讀者留下深刻的印象，並引誘讀者想要仔細看這篇論文，畢竟很多讀者的習慣是先讀頭尾，必須要想辦法引人入勝。然而重點是避免結論被混淆，通常一篇論文不會有太多結論，往往一篇有名的文獻只有一個結論能代表該文獻。所以千萬不要使其受到混淆，而模糊了焦點。
那麼要如何寫出一個好的結論呢？寫結論跟討論一樣，有幾個必要，也有幾個避免。結論應該要重申假設或所研究的問題、重申主要發現，將這篇論文對文獻貢獻彰顯出來，最後要強調這篇論文的限制，並且建議這篇論文的未來方向。為了避免混淆，結論要避免引入新的論點、新的數據，不應去忽略本篇論文的問題，也不應將主要的結果作輕描淡寫。