手稿可表達這數個月或數年來，從一連串實驗中所收集到的數據。然而，原始數據或敘述本身並不足以成為好的期刊論文。數據視覺化工具和免費繪圖軟體能够讓科學家解釋他們的科學故事。絕大部分的讀者的閱讀習慣，一向是有圖先看圖，有表先看表，有公式先看公式，最後才看文字。以這些工具來使科學插圖更加完善，可以牢牢地抓住審稿人的注意力。更重要的是，它將有助於讀者快速了解數據，增加引用和分享研究論文的可能性。
為什麼圖像品質很重要
期刊對於圖表/圖像的品質有嚴格的指導方針，例如每個圖像的像素數(pixel number)或是解析度(每英寸多少像素點，DPI)。如果圖像品質不好，則編輯或其他工作人員將會在審查之前，便把手稿給拒絕掉。此外，品質差的圖像會給讀者和審稿人留下不好的印象。所以在編輯和製作科學圖像時，一定要使用科學文章專用的插圖軟體或繪圖工具，使您的數據清晰易懂！
讀者的閱讀往往時間很短，而表格可以迅速傳達數據給讀者。因此，當您設計表格時，可以花點巧思，讓您的論文可以產生更大的影響力。因此，您的表格應該清晰明確且具有描述性的表抬頭，每個欄位的定義要明確，每個儲存格中的資料應適當對齊，讓讀者能一目瞭然，或是方便比較。也因此，研究人員可以使用適當的工具來創建出版品的圖像。
一般工具的用途和限制
現在軟體很發達，作者可以挑選許多的工具使用；而選擇哪一個工作，要取決於你的電腦知識、預算和所希望得到的結果。
R，是一個免費的統計計算程式，適用於各種作業系統，有利於圖形的開發。它的優點是：即使欠缺有關賦予圖像真實化(rendering)的設計條件，但是依舊能輕易的產生具有出版品質水準的圖。由於R是免費的，所以它不會像訂閱服務所提供的軟體那麼方便使用，例如Prism，是隨著訂閱服務而提供允許數據分析和圖表開發的軟體。
ImageJ，是由美國國家衛生研究院(National Institutes of Health)開發的免費軟體。簡單來說，它是一個圖像處理程式，允許使用者編輯、分析、處理、保存、列印、修改顏色和圖像定量。它有一個很特殊的功能，是它能够從影片產生堆疊(stack)，也就是一系列圖像，或是將照片轉換成影片，這有助於活細胞成像。
Inkspace，是一個高品質的向量圖形編輯器，是一種開源軟體(open source software，OSS)，也就是原始碼可以任意取用的電腦軟體；並提供活用的繪圖工具。它具有廣泛的檔案格式相容性和強大的文字工具。
GIMP，是一個免費的圖像處理程式，可以結合外掛程式(Plug-in)來增強功能。與其它大多數其他圖像格式化工具相比，使用者必須要有更高的電腦知識。
Cytospace，是一個用於複雜網狀結構分析(complex network analysis)的開放原始程式碼，幫助使用者綜合、分析和視覺化數據。雖然它是免費使用的，但它並沒有像「Ingenuity Pathway Analysis」那麼方便使用者。「Ingenuity Pathway Analysis」可以非常輕鬆地設計，並且呈現真實化、藝術化，不過這不是免費軟體。
ImageMagick，可以用來讀寫在許多常用的格式，例如PNG、JPEG、FIG、TIFF、PDF等格式。它幾乎可以以任何方式修改圖像，也讓使用者可以組合圖像、動畫、色彩管理、修圖、繪圖和描圖等。此外，它也與多種編碼語言相容。
小提示
- 建立圖表可以是一個有趣的過程，但重要的是，始終正確地執行。首先，在交稿之前，請先檢查圖像所需的格式。如果必須轉換為圖像檔案，請請確定其解析度必須在300 DPI以上。
- 在交稿之前，先仔細檢查圖表的錯誤。最有效的作法，也是最笨的作法，就是將圖表以彩色列印出，然後手動查看。換一個思維，用紙本來審閱，拿筆來批改，經常可以發現在電腦上閱讀檔案時所未察覺到的怪事。
- 在修改圖像進行出版時，千萬不要作假，不依照真實數據來做圖像，是種欺騙的行為。西方墨點法(Western blot)，或稱蛋白質轉漬法，通常是最可疑的圖像，審稿人會仔細把關的。
- 最後，雖然大量數據是有幫助的，但請確保減少「爛圖表(chartjunk)」的存在，不必要的視覺元素會模糊焦點，使讀者忽視真正重要的東西 ~ 你的數據！